东南亚神学院于1994年6月25日在新加坡亚当堂举行第一届毕业典礼，当日出席观礼的除新加坡的信徒和毕业生的亲人外，还包括了马新总会的代表黄约翰执事及鹅唛教会的冯约书亚执事。
这次一共有三位神学生毕业，他们是来自沙巴的朱柏灵、鹅唛的陈永国及吉隆坡的张永福，从1990年10月1日开始接受神学训练，完成了三年的神学课程，其间也到过马新、沙巴和台湾各教会实习。感谢主的安排使东南亚神学院能在联总、台总、马新总会及沙巴总会的大力支持下，培养出第一批“土生土长”的传道人，愿主的灵继续带领，并感动更多青年献身参与全职的事工。
陈西门传道主持毕业典礼，勉励大家将身体献上当作活祭，此乃圣洁蒙神喜悦的︵︶。今天我们若要将福音传遍全球，就一定要有更多的全职圣工人员，人力短缺不但拖延圣工的发展，更影响信徒的信心。感谢主在此刻感动三位青年前来献身，他们放下自己的家庭和事业，作出种种的调整，为要完成神所托付的使命。陈传道最后勉励毕业生要学以致用，亦希望信徒能记念并关心全职的工人，他们虽有软弱，但靠大家不住地代祷及神的大能必能得胜。
神学院院长陈约翰执事盼望即将毕业的神学生不要自恃过高，看自己比别人强，乃要善用主所加添的传道恩赐，为主广传福音，造就众人；除了殷勤的工作外，还需加上恳切的祷告及恒切的查考圣经。此外也提醒他们穿着要适宜并要注意饮食健康，没有健康就不能事奉主，在工作上不可偷懒，亦不该操劳过度，凡事应合乎中道。
马新总会代表黄约翰执事表示，主对工人的要求在质不在量。三年来，他们从前辈的身上学习了不少知识及经验，还盼望他们毕业以后能继续不断地充实自已，多多学习，大家既为主放弃了世界，就不可半途而废，要贯彻所立的志向，坚持到底。
黄执事也勉励毕业生要有爱心、耐心、信心、虚心、专心，并在工作上有诚意及乐意，一切都应该全为主、勤为主、欢然忠诚永为主，同时也在顺服、忠心、殷勤上显出好牧人的素质，使马新及沙巴的圣工在神的祝福下能大大兴旺起来。
谢坚信执事代表新加坡教会，感谢主让新加坡有机会来帮助神学院的圣工，他表示我们所领受的其实远超过我们所付出的；世界各地长执传道的到来使新加坡教会获益不浅。他鼓励毕业生当走在羊的前面，凡事以身作则，在各方面作信徒的榜样︵︶；他希望神的灵大大感动我们的工人，使一代比一代更优秀。
最后，朱柏灵弟兄代表毕业生向联总、台总、马新总会、沙巴总会及神学院致谢；他们也感谢新加坡教会及同灵给予的帮助与爱心，家人的支持与关怀、鼓励。愿主记念大家的劳苦，愿主的恩惠多多加给各人，愿一切荣耀归主名，阿们！ ~F